Goodman, L. S. et al. Азотная горчичная терапия; использование гидрохлорида метил-бис (бета-хлорэтил) амина и гидрохлорида трис (бета-хлорэтил) амина при болезни Ходжкина, лимфосаркоме, лейкемии и некоторых родственных и различных заболеваниях. J. Am. Med. Assoc . 132 , 126–132 (1946). Это и следующее исследование (ссылка 2) были первыми клиническими отчетами о химиотерапии при запущенных формах рака .

CAS PubMed Google ученый

Фарбер С. и Даймонд Л. К. Временные ремиссии острого лейкоза у детей, вызванные антагонистом фолиевой кислоты, 4-аминоптероилглутаминовой кислотой. N. Engl. J. Med . 238 , 787–793 (1948).

CAS PubMed Google ученый

Крофтон Дж. Химиотерапия туберкулеза легких. BMJ 1 , 1610–1614 (1959).

CAS PubMed Google ученый

DeVita, V. T., Jr et al. Излечимость прогрессирующей болезни Ходжкина с помощью химиотерапии. Долгосрочное наблюдение за пациентами, получавшими MOPP, в Национальном институте рака. Ann. Междунар. Med . 92 , 587–595 (1980). Это и следующее исследование (ссылка 5) были первыми клиническими испытаниями комбинированной химиотерапии при запущенной лимфоме Ходжкина и локализованном раке груди, соответственно .

PubMed Google ученый

Bonadonna, G. et al. Комбинированная химиотерапия как вспомогательное средство при операбельном раке молочной железы. N. Engl. J. Med . 294 , 405–410 (1976).

CAS PubMed Google ученый

Bosl, G.J. et al. VAB-6: эффективный режим химиотерапии для пациентов с опухолями половых клеток. J. Clin.Онкол . 4 , 1493–1499 (1986).

CAS PubMed Google ученый

Гринюк В. и Буш Х. Важность интенсивности дозы в химиотерапии метастатического рака молочной железы. J. Clin. Онкол . 2 , 1281–1288 (1984).

CAS PubMed Google ученый

Citron, M. L. et al. Рандомизированное испытание плотной дозы по сравнению с традиционно запланированной и последовательной по сравнению с сопутствующей комбинированной химиотерапией в качестве адъювантного послеоперационного лечения первичного рака молочной железы с положительным лимфоузлом: первый отчет межгруппового исследования C9741 / Рак и лейкемия Группа B Испытание 9741. J. Clin. Онкол . 21 , 1431–1439 (2003).

CAS PubMed Google ученый

Sternberg, C. N. et al. Рандомизированное исследование III фазы высокодозной химиотерапии метотрексатом, винбластином, доксорубицином и цисплатином (MVAC) и рекомбинантным гранулоцитарным колониестимулирующим фактором человека в сравнении с классическим MVAC при распространенных опухолях уротелиального тракта: Протокол Европейской организации по исследованию и лечению рака №30924. J. Clin. Онкол . 19 , 2638–2646 (2001).

CAS PubMed Google ученый

Ханахан Д. и Вайнберг Р. А. Признаки рака. Cell 100 , 57–70 (2000).

CAS Google ученый

Ханахан Д. и Вайнберг Р. А. Признаки рака: следующее поколение. Cell 144 , 646–674 (2011).

CAS PubMed Google ученый

Лич, Д. Р., Краммель, М. Ф. и Эллисон, Дж. П. Повышение противоопухолевого иммунитета за счет блокады CTLA-4. Наука 271 , 1734–1736 (1996).

ADS CAS PubMed Google ученый

Iwai, Y. et al. Участие PD-L1 в опухолевых клетках при уходе от иммунной системы хозяина и иммунотерапии опухолей посредством блокады PD-L1. Proc. Natl Acad. Sci. США 99 , 12293–12297 (2002).

ADS CAS PubMed Google ученый

Рибас А. и Волчок Дж. Д. Иммунотерапия рака с использованием блокады контрольных точек. Наука 359 , 1350–1355 (2018).

ADS CAS PubMed Google ученый

Glickman, M. S. & Sawyers, C.L. Превращение методов лечения рака в лекарства: уроки инфекционных болезней. Cell 148 , 1089–1098 (2012).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Голди, Дж. Х. и Колдман, А. Дж. Генетическое происхождение лекарственной устойчивости новообразований: значение для системной терапии. Cancer Res . 44 , 3643–3653 (1984).

CAS PubMed Google ученый

Фишер Б., Слэк Н. Х. и Бросс И. Д. Рак груди: размер новообразования и прогноз. Рак 24 , 1071–1080 (1969).

CAS PubMed Google ученый

Скиппер, Х. Э., Шабель, Ф. М., младший и Уилкокс, У. С. Экспериментальная оценка потенциальных противораковых агентов. XIII. О критериях и кинетике «излечимости» экспериментального лейкоза. Химиотерапия рака.Репу . 35 , 1–111 (1964).

CAS PubMed Google ученый

Голди, Дж. Х. и Колдман, А. Дж. Математическая модель для связи лекарственной чувствительности опухолей со скоростью их спонтанных мутаций. Лечение рака. Репу . 63 , 1727–1733 (1979).

CAS PubMed Google ученый

Лурия, С. Э. и Дельбрюк, М.Мутации бактерий от чувствительности к вирусам до устойчивости к вирусам. Генетика 28 , 491–511 (1943).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Тэннок, И. Ф. Рак: сопротивление через репопуляцию. Природа 517 , 152–153 (2015).

ADS CAS PubMed Google ученый

Нортон, Л., Саймон, Р., Бреретон, Х. Д. и Богден, А. Э. Прогнозирование курса роста Гомперца. Nature 264 , 542–545 (1976). Это исследование, ссылки 23 и 24, являются одними из первых приложений математических моделей кинетики роста Гомперца для роста опухоли и ответа на терапию .

ADS CAS PubMed Google ученый

Лэрд А.К. Динамика роста опухоли. АНЛ-6723.ANL Rep . 1963 , 216–222 (1963).

Google ученый

Нортон Л. и Саймон Р. Кривая роста экспериментальной солидной опухоли после лучевой терапии. J. Natl Cancer Inst . 58 , 1735–1741 (1977).

CAS PubMed Google ученый

Совместная группа исследователей раннего рака молочной железы (EBCTCG). Повышение интенсивности дозы химиотерапии за счет более частого введения или последовательного планирования: метаанализ на уровне пациента 37 298 женщин с ранним раком груди в 26 рандомизированных испытаниях. Ланцет 393 , 1440–1452 (2019). Этот метаанализ более 37 000 пациентов из 26 рандомизированных клинических испытаний ранней стадии рака груди показывает, что химиотерапия с плотной дозой увеличивает общую выживаемость по сравнению с химиотерапией со стандартной интенсивностью дозы .

Google ученый

Katsumata, N. et al. Долгосрочные результаты высокодозного паклитаксела и карбоплатина по сравнению с обычным паклитакселом и карбоплатином для лечения распространенного эпителиального рака яичников, маточных труб или первичного рака брюшины (JGOG 3016): рандомизированное контролируемое открытое исследование. Ланцет Онкол . 14 , 1020–1026 (2013).

CAS PubMed Google ученый

Nowell, P.C. Клональная эволюция популяций опухолевых клеток. Science 194 , 23–28 (1976).

ADS CAS PubMed Google ученый

Александров, Л. Б. и др. Сигнатуры мутационных процессов при раке человека. Природа 500 , 415–421 (2013). В этом исследовании было проанализировано около 5 миллионов мутаций из примерно 7000 видов рака, чтобы получить 21 различную мутационную сигнатуру, включая сигнатуры ферментов APOBEC и kataegis .

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Ленгауэр, К., Кинзлер, К. В. и Фогельштейн, Б. Генетическая нестабильность при раке человека. Nature 396 , 643–649 (1998).

ADS CAS PubMed Google ученый

Stephens, P.J. et al. Массивная геномная перестройка произошла в результате одного катастрофического события во время развития рака. Cell 144 , 27–40 (2011).

MathSciNet CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Sansregret, L., Vanhaesebroeck, B. & Swanton, C.Детерминанты и клинические последствия хромосомной нестабильности при раке. Nat. Преподобный Clin. Онкол . 15 , 139–150 (2018).

CAS PubMed Google ученый

Гривз М. Эволюционные детерминанты рака. Рак Дисков . 5 , 806–820 (2015).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

McGranahan, N. & Swanton, C. Клональная гетерогенность и эволюция опухоли: прошлое, настоящее и будущее. Cell 168 , 613–628 (2017).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Johnson, B.E. et al. Мутационный анализ показывает происхождение и эволюцию рецидивирующей глиомы, обусловленную терапией. Наука 343 , 189–193 (2014).

ADS CAS PubMed Google ученый

Coombs, C.C. et al. Связанный с терапией клональный гемопоэз у пациентов с негематологическим раком является обычным явлением и связан с неблагоприятными клиническими исходами. Cell Stem Cell 21 , 374–382 (2017).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Zehir, A. et al. Мутационный ландшафт метастатического рака выявлен в результате проспективного клинического секвенирования 10 000 пациентов. Nat. Med . 23 , 703–713 (2017).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Яп, Т. А., Герлингер, М., Футреаль, П. А., Пуштаи, Л. и Свантон, К. Внутриопухолевая неоднородность: видение древесины для деревьев. Sci. Пер. Med . 4 , 127ps10 (2012).

PubMed Google ученый

Schiavon, G. et al. Анализ мутации ESR1 в циркулирующей опухолевой ДНК демонстрирует эволюцию во время терапии метастатического рака молочной железы. Sci. Пер. Med . 7 , 313ра182 (2015).

PubMed PubMed Central Google ученый

McGranahan, N. et al. Клональный статус событий, вызывающих действия, и время мутационных процессов в развитии рака. Sci. Пер. Med . 7 , 283ра54 (2015).

PubMed PubMed Central Google ученый

Джайн, Р. К. Нормализация сосудистой сети опухоли: новая концепция антиангиогенной терапии. Наука 307 , 58–62 (2005).

ADS CAS PubMed Google ученый

Минчинтон А. И. и Таннок И. Ф. Проникновение лекарств в солидные опухоли. Nat. Rev. Cancer 6 , 583–592 (2006).

CAS PubMed Google ученый

Makker, V. et al. Ленватиниб плюс пембролизумаб у пациентов с распространенным раком эндометрия: промежуточный анализ многоцентрового открытого однорангового исследования фазы 2. Ланцет Онкол . 20 , 711–718 (2019).

CAS PubMed Google ученый

Rini, B. I. et al. Пембролизумаб плюс акситиниб в сравнении с сунитинибом при запущенной почечно-клеточной карциноме. N. Engl. J. Med . 380 , 1116–1127 (2019).

CAS PubMed Google ученый

Andrews, D. W. et al. Лучевая терапия всего мозга с усилением стереотаксической радиохирургии или без нее для пациентов с одним или тремя метастазами в мозг: результаты III фазы рандомизированного исследования RTOG 9508. Ланцет 363 , 1665–1672 (2004).

PubMed Google ученый

Valiente, M. et al.Развитие метастазов в мозг. Trends Cancer 4 , 176–196 (2018).

PubMed PubMed Central Google ученый

Anderson, E. S. et al. Метастазы меланомы в мозг, леченные стереотаксической радиохирургией и одновременным приемом пембролизумаба, демонстрируют заметную регрессию; эффективность и безопасность комбинированного лечения. J. Immunother. Рак 5 , 76 (2017).

PubMed PubMed Central Google ученый

Chen, Q. et al. Щелевые контакты карцинома-астроцит способствуют метастазированию в мозг путем переноса цГАМФ. Природа 533 , 493–498 (2016).

ADS CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Valiente, M. et al. Серпины способствуют выживанию раковых клеток и сосудистой кооптации при метастазах в мозг. Cell 156 , 1002–1016 (2014).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Boire, A. et al. Компонент 3 комплемента адаптирует спинномозговую жидкость к лептоменингеальным метастазам. Cell 168 , 1101–1113 (2017).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Шарма П., Ху-Лиескован С., Варго Дж. А. и Рибас А. Первичная, адаптивная и приобретенная устойчивость к иммунотерапии рака. Cell 168 , 707–723 (2017).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Snyder, A. et al. Генетическая основа клинического ответа на блокаду CTLA-4 при меланоме. N. Engl. J. Med . 371 , 2189–2199 (2014).

PubMed PubMed Central Google ученый

Rizvi, N.A. et al. Иммунология рака. Мутационный ландшафт определяет чувствительность к блокаде PD-1 при немелкоклеточном раке легкого. Наука 348 , 124–128 (2015).

ADS CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Зарецкий, Дж. М. и др. Мутации, связанные с приобретенной устойчивостью к блокаде PD-1 при меланоме. N. Engl. J. Med . 375 , 819–829 (2016). Это исследование было одним из первых, открывших механизмы приобретенной устойчивости к блокаде контрольных точек при метастатической меланоме, включая мутации JAK и потерю β2-микроглобулина .

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

De Henau, O. et al. Преодоление устойчивости к терапии блокадой контрольных точек путем нацеливания на PI3Kγ в миелоидных клетках. Природа 539 , 443–447 (2016).

ADS PubMed PubMed Central Google ученый

Soucek, L. et al. Моделирование ингибирования Myc в качестве лечения рака. Природа 455 , 679–683 (2008).

ADS CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Острем, Дж. М., Петерс, У., Сос, М. Л., Уэллс, Дж. А. и Шокат, К. М. Ингибиторы K-Ras (G12C) аллостерически контролируют сродство к GTP и эффекторные взаимодействия. Природа 503 , 548–551 (2013).

ADS CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Lambert, J. M. et al. PRIMA-1 реактивирует мутантный p53 за счет ковалентного связывания с коровым доменом. Cancer Cell 15 , 376–388 (2009).

CAS PubMed Google ученый

Yao, Z. et al. Мутанты BRAF уклоняются от ERK-зависимой обратной связи с помощью различных механизмов, которые определяют их чувствительность к фармакологическому ингибированию. Cancer Cell 28 , 370–383 (2015).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Sullivan, R.J. et al. Первый в своем классе ингибитор ERK1 / 2 уликсертиниб (BVD-523) у пациентов с распространенными солидными опухолями с мутантным MAPK: результаты исследования фазы I увеличения и увеличения доз. Рак Дисков . 8 , 184–195 (2018).

CAS PubMed Google ученый

Karapetis, C. S. et al. K-ras мутаций и преимущества цетуксимаба при распространенном колоректальном раке. N. Engl. J. Med . 359 , 1757–1765 (2008).

CAS PubMed Google ученый

Глен, К. Д., Дуброва Ю.E. Воздействие противоопухолевых препаратов может привести к трансгенной геномной нестабильности у мышей. Proc. Natl Acad. Sci. США 109 , 2984–2988 (2012).

ADS CAS PubMed Google ученый

Shaked, Y. Уравновешивание эффективности и иммунных ответов хозяина на терапию рака: эффекты инь и ян. Nat. Преподобный Clin. Онкол . 13 , 611–626 (2016).

CAS PubMed Google ученый

Лито П., Розен Н. и Солит Д. Б. Адаптация опухоли и устойчивость к ингибиторам RAF. Nat. Med . 19 , 1401–1409 (2013).

CAS PubMed Google ученый

Сан, К. и Бернардс, Р. Обратная связь и избыточность в передаче сигналов рецепторной тирозинкиназы: актуальность для лечения рака. Trends Biochem. Sci . 39 , 465–474 (2014).

CAS PubMed Google ученый

Prahallad, A. et al. Невосприимчивость рака толстой кишки к ингибированию BRAF (V600E) за счет активации EGFR с помощью обратной связи. Природа 483 , 100–103 (2012).

ADS CAS PubMed Google ученый

Corcoran, R. B. et al. EGFR-опосредованная реактивация передачи сигналов MAPK способствует нечувствительности мутантного колоректального рака BRAF к ингибированию RAF с помощью вемурафениба. Рак Дисков . 2 , 227–235 (2012).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Азам М., Силигер М. А., Грей Н. С., Куриян Дж. И Дейли Г. К. Активация тирозинкиназ путем мутации треонина-привратника. Nat. Struct. Мол. Биол . 15 , 1109–1118 (2008).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Чжан, Дж., Ян, П. Л. и Грей, Н. С. Противодействие раку с помощью низкомолекулярных ингибиторов киназ. Nat. Rev. Cancer 9 , 28–39 (2009).

PubMed Google ученый

Cortes, J. E. et al. Испытание фазы 2 понатиниба при лейкозах с положительными хромосомами в Филадельфии. N. Engl. J. Med . 369 , 1783–1796 (2013).

CAS PubMed Google ученый

Shaw, A. T. et al. Алектиниб в ALK — положительном, кризотиниб-резистентном немелкоклеточном раке легкого: одногрупповое, многоцентровое исследование фазы 2. Ланцет Онкол . 17 , 234–242 (2016).

CAS PubMed Google ученый

Mok, T. S. et al. Осимертиниб или платиновый пеметрексед при EGFR T790M-положительном раке легкого. N. Engl. J. Med . 376 , 629–640 (2017).

CAS PubMed Google ученый

Toy, W. et al. Мутации лиганд-связывающего домена ESR1 при гормонорезистентном раке молочной железы. Nat. Genet . 45 , 1439–1445 (2013).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Engelman, J. A. et al. Амплификация MET приводит к устойчивости к гефитинибу при раке легких за счет активации передачи сигналов ERBB3. Наука 316 , 1039–1043 (2007).

ADS CAS PubMed Google ученый

Juric, D. et al. Конвергентная потеря PTEN приводит к клинической устойчивости к ингибитору PI (3) Kα. Природа 518 , 240–244 (2015).

ADS CAS PubMed Google ученый

Patch, A. M. et al. Полногеномная характеристика химиорезистентного рака яичников. Природа 521 , 489–494 (2015).

ADS CAS PubMed Google ученый

Mu, P. et al. SOX2 способствует пластичности клонов и устойчивости к антиандрогенам при TP53 — и RB1 — раке простаты. Наука 355 , 84–88 (2017).

ADS CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Озер, М. Г., Нидерст, М. Дж., Секвист, Л. В. и Энгельман, Дж. А. Трансформация немелкоклеточного рака легкого в мелкоклеточный рак легкого: молекулярные драйверы и клетки происхождения. Ланцет Онкол . 16 , e165 – e172 (2015).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Блэкберн, Э. Х. Перехват рака. Рак Пред. Res . 4 , 787–792 (2011). Насколько нам известно, этот документ был первым, в котором была систематизирована концепция перехвата рака .

CAS Google ученый

Shieh, Y. et al. Популяционный скрининг на рак: надежда и шумиха. Nat. Преподобный Clin. Онкол . 13 , 550–565 (2016).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Myers, E. R. et al. Польза и вред скрининга рака груди: систематический обзор. J. Am. Med. Assoc . 314 , 1615–1634 (2015).

CAS Google ученый

Elmore, J. G. et al. Десятилетний риск ложноположительных результатов маммограмм и клинических обследований молочных желез. N. Engl. J. Med . 338 , 1089–1096 (1998).

CAS PubMed Google ученый

Martin, R.M. et al. Влияние низкоинтенсивного скринингового вмешательства на основе ПСА на смертность от рака простаты: рандомизированное клиническое исследование CAP. J. Am. Med. Assoc . 319 , 883–895 (2018).

Google ученый

Lo, Y. M. et al. Наличие ДНК плода в плазме и сыворотке матери. Ланцет 350 , 485–487 (1997).

CAS Google ученый

Lo, Y. M. et al. Секвенирование ДНК материнской плазмы выявляет генетический и мутационный профиль плода по всему геному. Sci. Пер. Med . 2 , 61ра91 (2010).

CAS PubMed Google ученый

Леон, С. А., Шапиро, Б., Скларофф, Д. М. и Ярос, М. Дж. Свободная ДНК в сыворотке онкологических больных и эффект терапии. Cancer Res . 37 , 646–650 (1977). Этот клинический отчет был первым, насколько нам известно, обнаружил циркулирующую ДНК в сыворотке больных раком и показал, что уровни ДНК коррелируют с терапевтическим вмешательством .

CAS PubMed Google ученый

Wan, J. C. M. et al. Жидкие биопсии достигли совершеннолетия: к внедрению циркулирующей опухолевой ДНК. Nat. Rev. Cancer 17 , 223–238 (2017).

CAS Google ученый

Stroun, M., Anker, P., Lyautey, J., Lederrey, C. & Maurice, P.A. Выделение и характеристика ДНК из плазмы больных раком. евро. J. Cancer Clin. Онкол . 23 , 707–712 (1987).

CAS PubMed Google ученый

Chen, X.Q. et al. Микросателлитные изменения в плазменной ДНК пациентов с мелкоклеточным раком легкого. Nat. Med . 2 , 1033–1035 (1996).

CAS PubMed Google ученый

Навроз, Х., Кох, В., Анкер, П., Строун, М.& Сидранский Д. Микросателлитные изменения в сывороточной ДНК больных раком головы и шеи. Nat. Med . 2 , 1035–1037 (1996).

CAS PubMed Google ученый

Vogelstein, B. & Kinzler, K. W. Цифровая ПЦР. Proc. Natl Acad. Sci. США 96 , 9236–9241 (1999).

ADS CAS PubMed Google ученый

Дрессман Д., Ян Х., Траверсо Г., Кинзлер К. В. и Фогельштейн Б. Преобразование отдельных молекул ДНК во флуоресцентные магнитные частицы для обнаружения и подсчета генетических вариаций. Proc. Natl Acad. Sci. США 100 , 8817–8822 (2003).

ADS CAS PubMed Google ученый

Newman, A. M. et al. Встроенное подавление цифровых ошибок для улучшенного обнаружения циркулирующей ДНК опухоли. Nat. Биотехнология . 34 , 547–555 (2016).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Кинде, И., Ву, Дж., Пападопулос, Н., Кинзлер, К. В. и Фогельштейн, Б. Обнаружение и количественная оценка редких мутаций с массовым параллельным секвенированием. Proc. Natl Acad. Sci. США 108 , 9530–9535 (2011).

ADS PubMed Google ученый

Siravegna, G., Marsoni, S., Siena, S. & Bardelli, A. Интеграция жидкостной биопсии в лечение рака. Nat. Преподобный Clin. Онкол . 14 , 531–548 (2017).

CAS PubMed Google ученый

Abbosh, C. et al. Филогенетический анализ цтДНК показывает эволюцию рака легких на ранней стадии. Природа 545 , 446–451 (2017).

ADS CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Cohen, J. D. et al. Выявление и локализация хирургически резектабельных раковых опухолей с помощью анализа крови на несколько аналитов. Наука 359 , 926–930 (2018).

ADS CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Klein, E.A. et al. Разработка комплексного анализа внеклеточной ДНК (вкДНК) для раннего выявления нескольких типов опухолей: исследование «Атлас бесклеточного генома» (CCGA). Дж.Clin. Онкол . 36 , 12021 (2018).

Google ученый

Bettegowda, C. et al. Обнаружение циркулирующей опухолевой ДНК на ранних и поздних стадиях злокачественных новообразований человека. Sci. Пер. Med . 6 , 224ра24 (2014).

PubMed PubMed Central Google ученый

Ван А. З., Лангер Р. и Фарохзад О. С. Доставка наночастиц противораковых препаратов. Annu. Ред. Med . 63 , 185–198 (2012).

CAS PubMed Google ученый

Lancet, J. E. et al. Липосома CPX-351 (цитарабин и даунорубицин) для инъекций по сравнению с традиционным цитарабином плюс даунорубицин у пожилых пациентов с впервые диагностированным вторичным острым миелоидным лейкозом. J. Clin. Онкол . 36 , 2684–2692 (2018).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Thomas, E. D. et al. Трансплантация костного мозга при остром нелимфобластном лейкозе в первой ремиссии. N. Engl. J. Med . 301 , 597–599 (1979).

CAS PubMed Google ученый

Peters, W. P. et al. Проспективное рандомизированное сравнение химиотерапии высокими дозами с поддержкой стволовыми клетками и химиотерапией средней дозой после операции и адъювантной химиотерапией у женщин с первичным раком молочной железы высокого риска: отчет CALGB 9082, SWOG 9114 и NCIC MA-13. J. Clin. Онкол . 23 , 2191–2200 (2005).

PubMed Google ученый

Jonas, O. et al. Имплантируемое микроустройство для проведения высокопроизводительных тестов in vivo на лекарственную чувствительность опухолей. Sci. Пер. Med . 7 , 284ра57 (2015).

PubMed PubMed Central Google ученый

Кемени, Н. Э. и Гонен, М.Инфузия печеночной артерии после резекции печени. N. Engl. J. Med . 352 , 734–735 (2005).

CAS PubMed Google ученый

Бек, А., Гетч, Л., Дюмонте, С. и Корвайя, Н. Стратегии и проблемы для следующего поколения конъюгатов антитело-лекарственное средство. Nat. Rev. Drug Discov . 16 , 315–337 (2017).

CAS PubMed Google ученый

Modi, S. et al. Трастузумаб дерукстекан (DS-8201a) у субъектов с раком молочной железы с низким уровнем экспрессии HER2: обновленные результаты большого исследования фазы 1. Cancer Res . 79 , абстр. P6–17–02 (2019).

Google ученый

Robert, C. et al. Ниволумаб при ранее нелеченой меланоме без мутации BRAF . N. Engl. J. Med . 372 , 320–330 (2015).

CAS PubMed Google ученый

Le, D. T. et al. Дефицит репарации несоответствия предсказывает ответ солидных опухолей на блокаду PD-1. Наука 357 , 409–413 (2017).

ADS CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Hellmann, M. D. et al. Ниволумаб плюс ипилимумаб при раке легких с высокой мутационной нагрузкой опухоли. N. Engl. J. Med . 378 , 2093–2104 (2018).

CAS PubMed Google ученый

Vogel, C. L. et al. Эффективность и безопасность трастузумаба в качестве единственного агента в лечении первой линии метастатического рака молочной железы с повышенной экспрессией HER2 . J. Clin. Онкол . 20 , 719–726 (2002).

CAS PubMed Google ученый

Baselga, J. et al. Пертузумаб плюс трастузумаб плюс доцетаксел при метастатическом раке молочной железы. N. Engl. J. Med . 366 , 109–119 (2012).

CAS PubMed Google ученый

Soria, J. C. et al. Осимертиниб при необработанном EGFR -мутировавшем распространенном немелкоклеточном раке легкого. N. Engl. J. Med . 378 , 113–125 (2018). Это клиническое испытание и следующее (ссылка 113) продемонстрировали превосходство более эффективных и специфичных для мутантов TKI в качестве лечения первой линии по сравнению с TKI первого поколения в EGFR -мутированных и ALK — перенесенный NSCLC .

CAS PubMed Google ученый

Peters, S. et al. Сравнение алектиниба и кризотиниба при нелеченом ALK -положительном немелкоклеточном раке легкого. N. Engl. J. Med . 377 , 829–838 (2017).

CAS PubMed Google ученый

Wylie, A. A. et al. Аллостерический ингибитор ABL001 обеспечивает двойное нацеливание на BCR-ABL1. Природа 543 , 733–737 (2017).

ADS CAS PubMed Google ученый

Moore, K. et al. Поддерживающая терапия олапарибом у пациентов с недавно диагностированным прогрессирующим раком яичников. N. Engl. J. Med . 379 , 2495–2505 (2018).

CAS PubMed Google ученый

Mirza, M. R. et al. Поддерживающая терапия нирапарибом при рецидивирующем раке яичников, чувствительном к платине. N. Engl. J. Med . 375 , 2154–2164 (2016).

CAS PubMed Google ученый

André, F. et al. Алпелисиб для PIK3CA -мутированный, распространенный рак молочной железы, положительный по рецепторам гормонов. N. Engl. J. Med . 380 , 1929–1940 (2019).

PubMed Google ученый

Hopkins, B.D. et al. Подавление инсулиновой обратной связи увеличивает эффективность ингибиторов PI3K. Природа 560 , 499–503 (2018).

ADS CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Roberts, A. W. et al. Нацеливание на BCL2 с помощью venetoclax при рецидиве хронического лимфолейкоза. N. Engl. J. Med . 374 , 311–322 (2016).

CAS PubMed Google ученый

Garcia-Murillas, I.и другие. Отслеживание мутаций в циркулирующей опухолевой ДНК позволяет прогнозировать рецидив рака груди на ранней стадии. Sci. Пер. Med . 7 , 302ра133 (2015).

PubMed Google ученый

Abbosh, C., Birkbak, N. J. & Swanton, C. Ранняя стадия НМРЛ — проблемы для проведения скрининга на основе цДНК и обнаружения MRD. Nat. Преподобный Clin. Онкол . 15 , 577–586 (2018).

CAS PubMed Google ученый

Dawson, S.J. et al. Анализ циркулирующей опухолевой ДНК для мониторинга метастатического рака груди. N. Engl. J. Med . 368 , 1199–1209 (2013).

CAS PubMed Google ученый

Corcoran, R. B. et al. Комбинированное ингибирование BRAF и MEK с дабрафенибом и траметинибом при BRAFV600 -мутантном колоректальном раке. J. Clin. Онкол . 33 , 4023–4031 (2015).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Rizvi, N.A. et al. Дурвалумаб с тремелимумабом или без него по сравнению с химиотерапией на основе платины в качестве лечения первой линии метастатического немелкоклеточного рака легкого: МИСТИК. Ann. Онкол . 29 , абстр. LBA6 (2018).

Google ученый

Johnson, P. et al. Адаптированное лечение под контролем промежуточного ПЭТ-КТ при прогрессирующей лимфоме Ходжкина. N. Engl. J. Med . 374 , 2419–2429 (2016).

PubMed PubMed Central Google ученый

Murtaza, M. et al. Мультифокальная клональная эволюция, охарактеризованная с использованием циркулирующей опухолевой ДНК в случае метастатического рака молочной железы. Nat. Коммуна . 6 , 8760 (2015).

ADS PubMed PubMed Central Google ученый

Diehl, F. et al. Циркулирующая мутантная ДНК для оценки динамики опухоли. Nat. Med . 14 , 985–990 (2008).

CAS PubMed Google ученый

Murtaza, M. et al. Неинвазивный анализ приобретенной устойчивости к терапии рака путем секвенирования ДНК плазмы. Природа 497 , 108–112 (2013).

ADS CAS PubMed Google ученый

Forshew, T. et al. Неинвазивная идентификация и мониторинг раковых мутаций с помощью целевого глубокого секвенирования ДНК плазмы. Sci. Пер. Med . 4 , 136ra68 (2012).

PubMed Google ученый

Misale, S. et al. Появление мутации KRAS и приобретенная устойчивость к терапии анти-EGFR при колоректальном раке. Природа 486 , 532–536 (2012).

ADS CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Kuang, Y.и другие. Неинвазивное обнаружение EGFR T790M при немелкоклеточном раке легкого, устойчивом к гефитинибу или эрлотинибу. Clin. Cancer Res . 15 , 2630–2636 (2009). Это трансляционное исследование показало возможность использования цтДНК плазмы для обнаружения EGFR ^T790M мутаций у пациентов с EGFR -мутировавших НМРЛ, которые прогрессировали на гефитинибе или эрлотинибе .

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Guernet, A. et al. CRISPR-штрих-кодирование для моделирования внутриопухолевой генетической гетерогенности и функционального анализа мутаций онкогенных драйверов. Мол. Ячейка 63 , 526–538 (2016).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Wu, Y. L. et al. Сравнение осимертиниба и пеметрекседа с платиной при распространенном НМРЛ с положительным результатом мутации T790M (AURA3): анализ ctDNA плазмы. J. Thorac. Онкол . 12 , S386 (2017).

Google ученый

Diaz, L.A. Jr et al. Молекулярная эволюция приобретенной устойчивости к целевой блокаде EGFR при колоректальном раке. Природа 486 , 537–540 (2012).

ADS CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Rodrik-Outmezguine, V.S. et al. Ингибирование киназы mTOR вызывает зависимую от обратной связи двухфазную регуляцию передачи сигналов AKT. Рак Дисков . 1 , 248–259 (2011).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Chandarlapaty, S. et al. Ингибирование AKT снимает подавление по обратной связи экспрессии и активности рецепторной тирозинкиназы. Cancer Cell 19 , 58–71 (2011).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Lito, P. et al. Ослабление глубокого подавления обратной связи митогенных сигналов ингибиторами RAF снижает их активность в меланомах BRAFV600E. Cancer Cell 22 , 668–682 (2012).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Johannessen, C. M. et al. Программа клонирования меланоцитов придает устойчивость к ингибированию пути киназы MAP. Природа 504 , 138–142 (2013).

ADS CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Wagle, N. et al. Изменения пути киназы MAP у пациентов с мутантной меланомой BRAF с приобретенной устойчивостью к комбинированному ингибированию RAF / MEK. Рак Дисков . 4 , 61–68 (2014).

CAS PubMed Google ученый

Van Allen, E.M. et al.Генетический ландшафт клинической устойчивости к ингибированию RAF при метастатической меланоме. Рак Дисков . 4 , 94–109 (2014).

PubMed Google ученый

Bosch, A. et al. Ингибирование PI3K приводит к усилению функции рецепторов эстрогена и зависимости при раке молочной железы, положительном по рецепторам гормонов. Sci. Пер. Med . 7 , 283ра51 (2015).

PubMed PubMed Central Google ученый

Toska, E. et al. Путь PI3K регулирует ER-зависимую транскрипцию при раке груди через эпигенетический регулятор KMT2D. Наука 355 , 1324–1330 (2017).

ADS CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Пеер Д. и Хакохен Н. Принципы и стратегии разработки сетевых моделей рака. Cell 144 , 864–873 (2011).

PubMed PubMed Central Google ученый

Гомес Техеда Занудо, Дж., Скалтрити, М. и Альберт, Р. Подход к сетевому моделированию для выяснения механизмов лекарственной устойчивости и прогнозирования комбинаторного лекарственного лечения рака груди. Рак Конверг . 1 , 5 (2017).

PubMed PubMed Central Google ученый

Drilon, A. et al. Эффективность ларотректиниба при TRK положительных раковых опухолях у взрослых и детей. N. Engl.J. Med . 378 , 731–739 (2018).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Drilon, A. et al. Ингибитор TRK-киназы следующего поколения преодолевает приобретенную устойчивость к предшествующему ингибированию TRK-киназы у пациентов с солидными опухолями, позитивными по слиянию TRK. Рак Дисков . 7 , 963–972 (2017). Это клиническое испытание демонстрирует активность LOXO-195, ингибитора TRK следующего поколения, который нацелен на мутанты TRK-фронта растворителя и киназного домена, и демонстрирует возможность разработки ингибиторов следующего поколения в режиме реального времени для борьбы с приобретенной резистентностью .

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Finn, R. S. et al. Палбоциклиб и летрозол при запущенном раке молочной железы. N. Engl. J. Med . 375 , 1925–1936 (2016).

CAS PubMed Google ученый

Farmer, H. et al. Нацеливание на дефект репарации ДНК в мутантных клетках BRCA в качестве терапевтической стратегии. Природа 434 , 917–921 (2005). Это был один из первых отчетов об использовании синтетической летальности при раке за счет ингибирования PARP в BRCA -мутантных клетках .

ADS CAS PubMed Google ученый

О’Нил, Н. Дж., Бейли, М. Л. и Хитер, П. Синтетическая летальность и рак. Nat. Ред. Genet . 18 , 613–623 (2017).

PubMed Google ученый

Мор, С. Э., Смит, Дж. А., Шаму, К. Э., Ноймюллер, Р. А. и Перримон, Н. Скрининг РНКи достигает совершеннолетия: усовершенствованные методы и дополнительные подходы. Nat. Rev. Mol. Ячейка Биол . 15 , 591–600 (2014).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Ван, Т., Вэй, Дж. Дж., Сабатини, Д.М. и Ландер, Э. С. Генетический скрининг в клетках человека с использованием системы CRISPR – Cas9. Наука 343 , 80–84 (2014). Насколько нам известно, это и следующие исследования (ссылка 152) являются первыми синтетическими скринингами летальности на основе CRISPR – Cas9, в которых был проведен скрининг на устойчивость к химиотерапии и таргетной терапии .

ADS CAS Google ученый

Shalem, O. et al. Скрининг нокаута CRISPR – Cas9 в масштабе генома в клетках человека. Наука 343 , 84–87 (2014).

ADS CAS Google ученый

Patel, S.J. et al. Идентификация основных генов для иммунотерапии рака. Природа 548 , 537–542 (2017).

ADS CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Burr, M. L. et al. CMTM6 поддерживает экспрессию PD-L1 и регулирует противоопухолевый иммунитет. Природа 549 , 101–105 (2017).

ADS CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Pan, D. et al. Главный регулятор хроматина определяет устойчивость опухолевых клеток к опосредованному Т-клетками уничтожению. Наука 359 , 770–775 (2018).

ADS CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Макдональд, Э. Р. III и др. Project DRIVE: сборник зависимостей от рака и синтетических летальных связей, выявленных в результате широкомасштабного глубокого скрининга РНКи. Cell 170 , 577–592 (2017).

CAS PubMed Google ученый

Черняк А. и др. Составление карты зависимости от рака. Cell 170 , 564–576 (2017).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Эшворт, А. и Лорд, К. Дж. Синтетические летальные методы лечения рака: что будет дальше после ингибиторов PARP? Nat. Преподобный Clin. Онкол . 15 , 564–576 (2018).

CAS PubMed Google ученый

Тэннок, И. Ф. и Хикман, Дж. А. Пределы персонализированной медицины рака. N. Engl. J. Med . 375 , 1289–1294 (2016).

PubMed Google ученый

Haque, I. S. & Elemento, O. Проблемы использования ctDNA для раннего выявления рака. Препринт на bioRxiv https://www.biorxiv.org/content/10.1101/237578v1 (2017).

Imperiale, T. F. et al. Многоцелевой анализ ДНК стула для скрининга колоректального рака. N. Engl. J. Med . 370 , 1287–1297 (2014).

CAS PubMed Google ученый

Кинде, И.и другие. Оценка ДНК из теста Папаниколау для выявления рака яичников и эндометрия. Sci. Пер. Med . 5 , 167ра4 (2013).

PubMed PubMed Central Google ученый

Андерхилл, Х. Р. и др. Длина фрагмента циркулирующей опухолевой ДНК. PLoS Genet . 12 , e1006162 (2016).

PubMed PubMed Central Google ученый

Lehmann-Werman, R. et al. Идентификация тканеспецифической гибели клеток с использованием паттернов метилирования циркулирующей ДНК. Proc. Natl Acad. Sci. США 113 , E1826 – E1834 (2016).

CAS PubMed Google ученый

Снайдер М. В., Кирчер М., Хилл А. Дж., Даза Р. М. и Шендуре Дж. Бесклеточная ДНК включает в себя нуклеосомный след in vivo, который определяет ее происхождение из тканей. Cell 164 , 57–68 (2016).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Bowman, R. L., Busque, L. & Levine, R. L. Клональный гематопоэз и эволюция к гематопоэтическим злокачественным новообразованиям. Cell Stem Cell 22 , 157–170 (2018).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Chan, K. C. A. et al. Анализ ДНК вируса Эпштейна-Барра в плазме для выявления рака носоглотки. N. Engl. J. Med . 377 , 513–522 (2017).

CAS PubMed Google ученый

Heitzer, E. et al. Связанные с опухолью изменения количества копий в обращении пациентов с раком простаты, идентифицированные с помощью полногеномного секвенирования. Геном Мед . 5 , 30 (2013).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Romanel, A. et al. Плазменный АР и абиратерон-резистентный рак простаты. Sci. Пер. Med . 7 , 312рэ10 (2015).

PubMed PubMed Central Google ученый

Скотт, А.М., Волчок, Дж. Д. и Олд, Л. Дж. Антитела-терапия рака. Nat. Rev. Cancer 12 , 278–287 (2012).

CAS PubMed Google ученый

Mayes, P. A., Hance, K. W. & Hoos, A. Перспективы и проблемы развития иммунных агонистических антител при раке. Nat. Rev. Drug. Discov. 17 , 509–527 (2018).

CAS PubMed Google ученый

Смагло, Б. Г., Альдегайтер, Д. и Вайнер, Л. М. Разработка иммуноконъюгатов для таргетной терапии рака. Nat. Преподобный Clin. Онкол. 11 , 637–648 (2014).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Мерик-Бернстам, Ф. и Миллс, Г. Б. Преодоление проблем внедрения персонализированной терапии рака. Nat. Преподобный Clin. Онкол. 9 , 542–548 (2012).

CAS PubMed Google ученый

Fong, C. Y. et al. Устойчивость к ингибиторам BET возникает из стволовых клеток лейкемии. Природа 525 , 538–542 (2015).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Kim, C. et al. Эволюция химиорезистентности при тройном отрицательном раке молочной железы, очерченная одноклеточным секвенированием. Ячейка 173 , 879–893.e13 (2018).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Писко, А.О. и Хуанг, С. Негенетическая пластичность раковых клеток и обусловленная терапией стволовость при рецидиве опухоли: «То, что меня не убивает, меня укрепляет». руб. J. Cancer 112 , 1725–1732 (2015).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Shlush, L. I. et al. Отслеживание происхождения рецидива острого миелоидного лейкоза до стволовых клеток. Природа 547 , 104–108 (2017).

CAS PubMed Google ученый

Hugo, W. et al. Негеномная и иммунная эволюция меланомы, приобретающей устойчивость к MAPKi. Cell 162 , 1271–1285 (2015).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Dobson, S.M. et al. Субклоны скрытой диагностики с рецидивом при остром лейкозе линии B устойчивы к лекарствам и обладают различными метаболическими программами. Рак Discov. 10 , 568–587 (2020).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

DeNicola, G.M. et al. Транскрипция Nrf2, индуцированная онкогеном, способствует детоксикации АФК и канцерогенезу. Природа 475 , 106–109 (2011).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Nakasone, E. S. et al. Визуализация взаимодействий опухоль-строма во время химиотерапии показывает вклад микросреды в резистентность. Cancer Cell 21 , 488–503 (2012).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Розенцвейг, С. А. Приобретенная устойчивость к лекарственным средствам, направленным на рецепторные тирозинкиназы. Biochem. Pharmacol. 83 , 1041–1048 (2012).

CAS PubMed Google ученый

Ким, Т. К., Хербст, Р. С. и Чен, Л.Определение и понимание адаптивной резистентности в иммунотерапии рака. Trends Immunol. 39 , 624–631 (2018).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Beltran, H. et al. Полное экзомное секвенирование метастатического рака и биомаркеры ответа на лечение. JAMA Oncol. 1 , 466–474 (2015).

PubMed PubMed Central Google ученый

Погребняк, К. Л. и Кертис, К. Использование эволюции опухоли для обхода устойчивости. Trends Genet. 34 , 639–651 (2018).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Sharma, S. V. et al. Опосредованное хроматином обратимое состояние лекарственной толерантности в субпопуляциях раковых клеток. Cell 141 , 69–80 (2010).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Menon, D. R. et al. Вызванная стрессом ранняя врожденная реакция вызывает множественную лекарственную толерантность при меланоме. Онкоген 34 , 4545 (2015).

CAS PubMed Google ученый

Dallas, N.A. et al. Химиорезистентные клетки колоректального рака, фенотип раковых стволовых клеток и повышенная чувствительность к ингибированию рецепторов инсулиноподобного фактора роста I. Cancer Res. 69 , 1951–1957 (2009).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Xue, Z. et al. Идентификация раковых стволовых клеток в линии клеток рака желудка SGC7901, предварительно обработанной винкристином. J. Cell Biochem. 113 , 302–312 (2012).

CAS PubMed Google ученый

Pirozzi, G. et al. Переход от эпителия к мезенхиме за счет индукции TGFbeta-1 увеличивает характеристики стволовости в клеточной линии первичного немелкоклеточного рака легкого. PLoS ONE 6 , e21548 (2011).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Gupta, P. B. et al. Стохастические переходы между состояниями приводят к фенотипическому равновесию в популяциях раковых клеток. Cell 146 , 633–644 (2011).

CAS PubMed Google ученый

Поляк, К., Вайнберг, Р.A. Переходы между эпителиальным и мезенхимальным состояниями: приобретение признаков злокачественных и стволовых клеток. Nat. Rev. Cancer 9 , 265–273 (2009).

CAS PubMed Google ученый

Сингх А. и Сеттлман Дж. ЕМТ, раковые стволовые клетки и лекарственная устойчивость: новая ось зла в войне с раком. Онкоген 29 , 4741–4751 (2010).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Хук, К. С. и Годинг, С. Р. Раковые стволовые клетки против переключения фенотипа при меланоме. Pigment Cell Melanoma Res. 23 , 746–759 (2010).

CAS PubMed Google ученый

Кемпер, К., де Гое, П. Л., Пипер, Д. С. и ван Амеронген, Р. Переключение фенотипа: пластичность опухолевых клеток как механизм сопротивления и мишень для терапии. Cancer Res. 74 , 5937–5941 (2014).

CAS PubMed Google ученый

Shaffer, S. M. et al. Изменчивость редких клеток и лекарственное перепрограммирование как способ лекарственной устойчивости рака. Природа 546 , 431–435 (2017).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Rambow, F. et al. К минимальной остаточной терапии, направленной на заболевание при меланоме. Cell 174 , 843–855 e19 (2018).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Boshuizen, J. et al. Совместное нацеливание на гетерогенность меланомы с помощью конъюгата антитело AXL-лекарственное средство и ингибиторов BRAF / MEK. Nat. Med. 24 , 203–212 (2018).

CAS PubMed Google ученый

Ли, Дж.H. et al. Подавление транскрипции MHC класса I и де-дифференцировка меланомы при устойчивости к ингибированию PD-1. Nat. Commun. 11 , 1897 (2020).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Koyama, S. et al. Адаптивная устойчивость к терапевтической блокаде PD-1 связана с активацией альтернативных иммунных контрольных точек. Nat. Commun. 7 , 10501 (2016).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Fallahi-Sichani, M. et al. Адаптивная устойчивость клеток меланомы к ингибированию RAF посредством обратимой индукции медленно делящегося де-дифференцированного состояния. Мол. Syst. Биол. 13 , 905 (2017).

PubMed PubMed Central Google ученый

Биггер Дж. Лечение стафилококковых инфекций пенициллином путем периодической стерилизации. Ланцет 244 , 497–500 (1944).

Google ученый

Холден Д. В. Микробиология. Персистер разоблачен. Наука 347 , 30–32 (2015).

CAS PubMed Google ученый

Su, Y. et al. Анализ отдельных клеток позволяет определить переходное состояние клеток и динамику передачи сигналов, связанных с лекарственной устойчивостью меланомы. Proc. Natl Acad. Sci. США 114 , 13679–13684 (2017).

CAS PubMed Google ученый

Tsoi, J. et al. Многоступенчатая дифференциация определяет подтипы меланомы с различной уязвимостью к железозависимому окислительному стрессу, вызванному лекарствами. Cancer Cell 33 , 890–904.e5 (2018).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Ding, L. et al. Клональная эволюция при рецидиве острого миелоидного лейкоза, выявленная с помощью полногеномного секвенирования. Природа 481 , 506–510 (2012).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Garg, M. et al. Профилирование соматических мутаций при остром миелоидном лейкозе с помощью FLT3-ITD при диагностике и рецидиве. Кровь 126 , 2491–2501 (2015).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Li, S. et al. Четкая эволюция и динамика эпигенетической и генетической гетерогенности при остром миелоидном лейкозе. Nat. Med. 22 , 792–799 (2016).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Shiba, N. et al. Секвенирование всего экзома выявляет спектр мутаций генов и паттерны клональной эволюции при остром миелоидном лейкозе у детей. руб. J. Haematol. 175 , 476–489 (2016).

CAS PubMed Google ученый

Rizos, H. et al. Механизмы устойчивости к ингибиторам BRAF при метастатической меланоме: спектр и клиническое влияние. Clin. Cancer Res. 20 , 1965–1977 (2014).

CAS PubMed Google ученый

Shi, H. et al. Новый мутант AKT1 усиливает адаптивный ответ меланомы на ингибирование BRAF. Рак Discov. 4 , 69–79 (2014).

CAS PubMed Google ученый

Boumahdi, S. & de Sauvage, F. J. Большой выход: пластичность опухолевых клеток при устойчивости к таргетной терапии. Nat. Rev. Drug Discov. 19 , 39–56 (2020).

CAS PubMed Google ученый

Bell, C.C. et al. Нацеленное переключение энхансера преодолевает негенетическую устойчивость к лекарствам при остром миелоидном лейкозе. Nat. Commun. 10 , 2723 (2019).

PubMed PubMed Central Google ученый

Chen, A. F. et al. GRHL2-зависимое переключение энхансеров поддерживает транскрипционную подсеть плюрипотентных стволовых клеток после выхода из наивной плюрипотентности. Cell Stem Cell 23 , 226–238.e4 (2018).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Kieffer-Kwon, K. R. et al. Карты взаимодействия регуляторных доменов генов мышей раскрывают основные принципы регуляции транскрипции. Cell 155 , 1507–1520 (2013).

CAS PubMed Google ученый

Iniguez, A. B. et al. Устойчивость к эпигенетической целевой терапии порождает уязвимость опухолевых клеток, связанную с ремоделированием энхансера. Cancer Cell 34 , 922–938.e7 (2018).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Hinohara, K. et al. Активность гистон-деметилазы KDM5 связывает клеточную транскриптомную гетерогенность с терапевтической резистентностью. Cancer Cell 34 , 939–953.e9 (2018).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Liau, B. B. et al. Адаптивное ремоделирование хроматина влияет на пластичность стволовых клеток глиобластомы и устойчивость к лекарствам. Cell Stem Cell 20 , 233–246.e7 (2017).

CAS PubMed Google ученый

Zawistowski, J. S. et al. Ремоделирование усилителя во время адаптивного обхода ингибирования MEK ослабляется фармакологическим воздействием на комплекс P-TEFb. Рак Discov. 7 , 302–321 (2017).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Stergachis, A. B. et al. Судьба развития и клеточная зрелость закодированы в ландшафтах регуляторной ДНК человека. Cell 154 , 888–903 (2013).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Пастушенко И. и др. Выявление переходных состояний опухоли при ЭМП. Природа 556 , 463–468 (2018).

CAS PubMed Google ученый

Puisieux, A., Pommier, R.M., Morel, A.P. и Lavial, F. Податливость клеток и многоступенчатый процесс туморогенеза. Cancer Cell 33 , 164–172 (2018).

CAS PubMed Google ученый

Morel, A. P. et al. Связанная со стволовостью ось ZEB1-MSRB3 регулирует клеточную податливость и стабильность генома рака молочной железы. Nat. Med. 23 , 568–578 (2017).

CAS PubMed Google ученый

Flavahan, W. A., Gaskell, E. & Bernstein, B. E. Эпигенетическая пластичность и признаки рака. Наука 357 , eaal2380 (2017).

PubMed PubMed Central Google ученый

Sanchez-Danes, A. et al. Популяция опухоли LGR5 с медленным циклом опосредует рецидив базальноклеточной карциномы после терапии. Природа 562 , 434–438 (2018).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Ханахан Д. и Вайнберг Р. А. Признаки рака: следующее поколение. Cell 144 , 646–674 (2011).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Umkehrer, C. et al. Выделение клонов живых клеток из популяций со штрих-кодом с использованием CRISPRa-индуцибельных репортеров. Nat. Biotechnol. https://doi.org/10.1038/s41587-020-0614-0 (2020).

Артикул PubMed Google ученый

Moudgil, A. et al. Транспозоны с самооценкой позволяют одновременно считывать экспрессию генов и связывание факторов транскрипции в отдельных клетках. Ячейка 182 , 992–1008.e21 (2020).

CAS PubMed Google ученый

Weinreb, C., Rodriguez-Fraticelli, A., Camargo, F. D. & Klein, A.M. Отслеживание происхождения в транскрипционных ландшафтах связывает состояние с судьбой во время дифференциации. Наука 367 , eaaw3381 (2020).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Russo, M. et al. Адаптивная изменчивость колоректального рака в ответ на таргетную терапию. Наука 366 , 1473–1480 (2019).

CAS PubMed Google ученый

Cipponi, A. et al. Передача сигналов MTOR управляет мутагенезом, вызванным стрессом, облегчая адаптивную эволюцию рака. Наука 368 , 1127–1131 (2020).

CAS PubMed Google ученый

Кадоч С. Разнообразные составы и функции машин ремоделирования хроматина при раке. Sci. Transl Med. 11 , eaay1018 (2019).

PubMed PubMed Central Google ученый

Agarwal, R. et al. Динамический молекулярный мониторинг показывает, что мутации SWI-SNF опосредуют резистентность к ибрутинибу плюс венетоклакс при лимфоме из клеток мантии. Nat. Med. 25 , 119–129 (2019).

CAS PubMed Google ученый

Xu, G. et al. ARID1A определяет идентичность просвета и терапевтический ответ при эстроген-рецептор-положительном раке молочной железы. Nat. Genet. 52 , 198–207 (2020).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Нагараджан, С.и другие. ARID1A влияет на активность HDAC1 / BRD4, внутреннюю пролиферативную способность и реакцию на лечение рака груди. Nat. Genet. 52 , 187–197 (2020).

CAS PubMed Google ученый

Quintanal-Villalonga, A. et al. Пластичность клонов при раке: общий путь терапевтической устойчивости. Nat. Преподобный Clin. Онкол. 17 , 360–371 (2020).

PubMed Google ученый

Озер, М. Г., Нидерст, М. Дж., Секвист, Л. В. и Энгельман, Дж. А. Трансформация немелкоклеточного рака легкого в мелкоклеточный рак легкого: молекулярные драйверы и клетки происхождения. Ланцет Онкол. 16 , e165 – e172 (2015).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Дэвис А. Х., Белтран Х. и Зубейди А. Клеточная пластичность и нейроэндокринный фенотип при раке простаты. Nat. Преподобный Урол. 15 , 271–286 (2018).

CAS PubMed Google ученый

Biehs, B. et al. Переключатель идентификации клеток позволяет остаточному BCC выжить при ингибировании пути Hedgehog. Природа 562 , 429–433 (2018).

CAS PubMed Google ученый

Sutherland, K. D. et al. Клетка происхождения мелкоклеточного рака легкого: инактивация Trp53 и Rb1 в различных типах клеток легкого взрослой мыши. Cancer Cell 19 , 754–764 (2011).

CAS PubMed Google ученый

Sutherland, K. D. et al. Множественные клетки происхождения мутантной K-Ras-индуцированной аденокарциномы легких мыши. Proc. Natl Acad. Sci. США 111 , 4952–4957 (2014).

CAS PubMed Google ученый

Lin, C. et al. Клетки альвеолярного типа II обладают способностью инициировать развитие опухоли легких. PLoS ONE 7 , e53817 (2012).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

George, J. et al. Обширные геномные профили мелкоклеточного рака легкого. Природа 524 , 47–53 (2015).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Lee, J. K. et al. Клональный анамнез и генетические предикторы трансформации аденокарцином легких в мелкоклеточные карциномы. J. Clin. Онкол. 35 , 3065–3074 (2017).

CAS PubMed Google ученый

Imielinski, M. et al. Картирование отличительных признаков аденокарциномы легких с массовым параллельным секвенированием. Cell 150 , 1107–1120 (2012).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Miettinen, P. J. et al.Незрелость эпителия и полиорганная недостаточность у мышей, лишенных рецептора эпидермального фактора роста. Nature 376 , 337–341 (1995).

CAS PubMed Google ученый

Sequist, L. V. et al. Генотипическая и гистологическая эволюция рака легких, приобретающего устойчивость к ингибиторам EGFR. Sci. Transl Med. 3 , 75ра26 (2011).

PubMed PubMed Central Google ученый

Takegawa, N. et al. Трансформация аденокарциномы с положительной перегруппировкой ALK в мелкоклеточный рак легкого в сочетании с приобретенной устойчивостью к алектинибу. Ann. Онкол. 27 , 953–955 (2016).

CAS PubMed Google ученый

Адельштейн, Д. Дж., Томашефски, Дж. Ф. Мл. Сноу, Н. Дж., Хорриган, Т. П. и Хайнс, Дж. Д. Смешанный мелкоклеточный и немелкоклеточный рак легкого. Сундук 89 , 699–704 (1986).

CAS PubMed Google ученый

Marcoux, N. et al. EGFR-мутантные аденокарциномы, которые трансформируются в мелкоклеточный рак легкого и другие нейроэндокринные карциномы: клинические результаты. J. Clin. Онкол. 37 , 278–285 (2019).

CAS PubMed Google ученый

Ku, S. Y. et al. Rb1 и Trp53 взаимодействуют для подавления пластичности клонов рака простаты, метастазирования и устойчивости к антиандрогенам. Наука 355 , 78–83 (2017).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Mu, P. et al. SOX2 способствует пластичности клонов и устойчивости к антиандрогенам при раке простаты с дефицитом TP53 и RB1. Наука 355 , 84–88 (2017).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Вальтер Д.M. et al. RB ограничивает верность клонов и множественные стадии прогрессирования и метастазирования опухоли. Nature 569 , 423–427 (2019).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Park, J. W. et al. Перепрограммирование нормальных эпителиальных тканей человека в общую, смертельную линию нейроэндокринного рака. Наука 362 , 91–95 (2018).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Dardenne, E. et al. N-Myc индуцирует EZh3-опосредованную программу транскрипции, приводящую к нейроэндокринному раку простаты. Cancer Cell 30 , 563–577 (2016).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Burr, M. L. et al. Эволюционно консервативная функция polycomb заглушает путь презентации антигена MHC класса I и делает возможным уклонение от иммунитета при раке. Cancer Cell 36 , 385–401.e8 (2019).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Bernards, R., Dessain, S.K. & Weinberg, R.A. Амплификация N-myc вызывает понижающую модуляцию экспрессии антигена MHC класса I в нейробластоме. Cell 47 , 667–674 (1986).

CAS PubMed Google ученый

Restifo, N.P. et al. Выявление раковых заболеваний человека, дефицитных по процессингу антигена. J. Exp. Med. 177 , 265–272 (1993).

CAS PubMed Google ученый

Paulson, K. G. et al. Приобретенная устойчивость рака к комбинированной иммунотерапии из-за потери транскрипции HLA класса I. Nat. Commun. 9 , 3868 (2018).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Агудо, Дж.и другие. Стволовые клетки покоящихся тканей ускользают от иммунного надзора. Иммунитет 48 , 271–285.e5 (2018).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Landsberg, J. et al. Меланомы сопротивляются Т-клеточной терапии за счет индуцированной воспалением обратимой дедифференцировки. Природа 490 , 412–416 (2012).

CAS PubMed Google ученый

Mehta, A. et al. Устойчивость к иммунотерапии за счет дедифференцировки, вызванной воспалением. Рак Discov. 8 , 935–943 (2018).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Majzner, R.G. & Mackall, C.L. Ускользание опухолевого антигена при терапии CAR Т-клетками. Рак Discov. 8 , 1219–1226 (2018).

CAS PubMed Google ученый

Maude, S. L. et al. Т-клетки химерного антигенного рецептора для устойчивой ремиссии при лейкемии. N. Engl. J. Med. 371 , 1507–1517 (2014).

PubMed PubMed Central Google ученый

Maude, S. L. et al. Устойчивые ремиссии Т-лимфоцитов, модифицированных CD19-специфическим химерным антигенным рецептором (CAR), у детей с рецидивирующим / рефрактерным ОЛЛ. J. Clin. Онкол. 34 , 3011–3011 (2016).

Google ученый

Park, J.H. et al. Долгосрочное наблюдение за терапией CD19 CAR при остром лимфобластном лейкозе. N. Engl. J. Med. 378 , 449–459 (2018).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Gardner, R. et al. Приобретение CD19-негативного миелоидного фенотипа позволяет иммунному ускользать от MLL-реаранжированного B-ALL от терапии CD19 CAR-T-клетками. Кровь 127 , 2406–2410 (2016).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Turtle, C.J. et al. CD19 CAR-T-клетки определенного состава CD4 +: CD8 + у взрослых пациентов с В-клеточным ОЛЛ. J. Clin. Инвестировать. 126 , 2123–2138 (2016).

PubMed PubMed Central Google ученый

Андерссон, А.K. et al. Пейзаж соматических мутаций при острых лимфобластных лейкозах младенцев с перестройкой MLL. Nat. Genet. 47 , 330–337 (2015).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Исследовательская сеть Атласа генома рака. Геномные и эпигеномные ландшафты острого миелоидного лейкоза взрослых de novo. N. Engl. J. Med. 368 , 2059–2074 (2013).

PubMed Central Google ученый

Гривз, М. Когда одна мутация — это все, что нужно. Cancer Cell 27 , 433–434 (2015).

CAS PubMed Google ученый

Кривцов А.В. и др. Трансформация коммитированных предшественников в стволовые клетки лейкемии, инициированная MLL-AF9. Природа 442 , 818–822 (2006).

CAS PubMed Google ученый

Jacoby, E. et al. Иммунное давление CD19 CAR вызывает переключение клонов B-предшественника острого лимфобластного лейкоза, проявляя присущую лейкемической пластичности. Nat. Commun. 7 , 12320 (2016).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Zoghbi, A., Zur Stadt, U., Winkler, B., Muller, I. & Escherich, G. Смена линии происхождения при лечении блинатумомабом рецидивирующего общего острого лимфобластного лейкоза без перегруппировки MLL. Pediatr. Рак крови 64 , e26594 (2017).

Google ученый

Rayes, A., McMasters, R. L. & O’Brien, M. M. Переключение линии происхождения при MLL-реаранжированной детской лейкемии после терапии, направленной на CD19. Pediatr. Рак крови 63 , 1113–1115 (2016).

CAS PubMed Google ученый

Xue, Y. et al.Подход к подавлению эволюции устойчивости при мутантном раке BRAF (V600E). Nat. Med. 23 , 929–937 (2017).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Гривз М. Эволюционные детерминанты рака. Рак Discov. 5 , 806–820 (2015).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

McGranahan, N. & Swanton, C. Клональная гетерогенность и эволюция опухоли: прошлое, настоящее и будущее. Cell 168 , 613–628 (2017).

CAS PubMed Google ученый

Дагого-Джек, И. и Шоу, А. Т. Неоднородность опухоли и устойчивость к терапии рака. Nat. Преподобный Clin. Онкол. 15 , 81–94 (2018).

CAS PubMed Google ученый

Чонг, С. Р. и Янне, П. А. Стремление преодолеть резистентность к терапии рака, направленной на EGFR. Nat. Med. 19 , 1389–1400 (2013).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Thress, K. S. et al. Приобретенная мутация EGFR C797S опосредует устойчивость к AZD9291 при немелкоклеточном раке легкого, несущем EGFR T790M. Nat. Med. 21 , 560–562 (2015).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Siravegna, G. et al. Клональная эволюция и устойчивость к блокаде EGFR в крови пациентов с колоректальным раком. Nat. Med. 21 , 827 (2015).

CAS PubMed Google ученый

Diaz, L.A. Jr. et al. Молекулярная эволюция приобретенной устойчивости к целевой блокаде EGFR при колоректальном раке. Природа 486 , 537–540 (2012).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Миллер, Т. В., Балко, Дж. М. и Артеага, С. Л. Фосфатидилинозитол-3-киназа и устойчивость к антиэстрогенам при раке молочной железы. J. Clin. Онкол. 29 , 4452–4461 (2011).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Christie, E. L. et al. Реверсия мутаций зародышевой линии BRCA1 / 2, обнаруженная в циркулирующей опухолевой ДНК пациентов с серозным раком яичников высокой степени. J. Clin.Онкол. 35 , 1274–1280 (2017).

CAS PubMed Google ученый

Tirosh, I. et al. Рассечение многоклеточной экосистемы метастатической меланомы с помощью одноклеточной RNA-seq. Наука 352 , 189–196 (2016).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

van Galen, P. et al. Одноклеточная РНК-Seq выявляет иерархию AML, имеющую отношение к прогрессированию заболевания и иммунитету. Ячейка 176 , 1265–1281.e24 (2019).

PubMed PubMed Central Google ученый

Miyamoto, D. T. et al. RNA-Seq одиночных CTCs простаты участвует в неканонической передаче сигналов Wnt в устойчивость к антиандрогенам. Наука 349 , 1351–1356 (2015).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Cheng, Y.H. et al. Hydro-Seq обеспечивает высокопроизводительное одноклеточное РНК-секвенирование циркулирующих опухолевых клеток без загрязнения. Nat. Commun. 10 , 2163 (2019).

PubMed PubMed Central Google ученый

Baryawno, N. et al. Клеточная систематика стромы костного мозга при гомеостазе и лейкемии. Cell 177 , 1915–1932.e16 (2019).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Rodriguez-Meira, A. et al. Выявление внутриопухолевой гетерогенности с помощью высокочувствительного анализа мутаций отдельных клеток и параллельного секвенирования РНК. Мол. Ячейка 73 , 1292–1305.e8 (2019).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Macaulay, I.C., Ponting, C.P. & Voet, T. Одноклеточная мультиомика: множественные измерения из отдельных ячеек. Trends Genet. 33 , 155–168 (2017).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Rozenblatt-Rosen, O. et al. Сеть атласа опухолей человека: отображение переходов опухоли в пространстве и времени с разрешением одной клетки. Cell 181 , 236–249 (2020).

CAS PubMed Google ученый

Tung, P. Y. et al. Пакетные эффекты и эффективный дизайн исследований экспрессии одноклеточных генов. Sci. Отчет 7 , 39921 (2017).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Stahl, P. L. et al. Визуализация и анализ экспрессии генов в срезах тканей с помощью пространственной транскриптомики. Наука 353 , 78–82 (2016).

CAS PubMed Google ученый

Wang, X. et al. Трехмерное секвенирование интактных тканей транскрипционных состояний отдельных клеток. Наука 361 , eaat5691 (2018).

PubMed PubMed Central Google ученый

Ke, R. et al. Секвенирование in situ для анализа РНК в консервированных тканях и клетках. Nat. Методы 10 , 857–860 (2013).

CAS PubMed Google ученый

Svedlund, J. et al. Создание OncoMaps на основе секвенирования in situ для пространственного определения профилей экспрессии генов диагностических и прогностических маркеров рака груди. EBioMedicine 48 , 212–223 (2019).

PubMed PubMed Central Google ученый

Xia, C., Fan, J., Emanuel, G., Hao, J. & Zhuang, X. Профилирование пространственного транскриптома с помощью MERFISH выявляет субклеточную компартментализацию РНК и зависимую от клеточного цикла экспрессию генов. Proc. Natl Acad. Sci. США 116 , 19490–19499 (2019).

CAS PubMed Google ученый

Rapino, F. et al. Репрограммирование кодон-специфической трансляции способствует устойчивости к таргетной терапии. Природа 558 , 605–609 (2018).

CAS PubMed Google ученый

Гарсиа-Хименес, К. и Годинг, К. Р. Голодание и псевдоголодание как движущие силы метастазирования рака посредством перепрограммирования перевода. Cell Metab. 29 , 254–267 (2019).

CAS PubMed Google ученый

Jewer, M. et al. Трансляционный контроль пластичности рака груди. Nat. Commun. 11 , 2498 (2020).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Giesen, C. et al. Мультиплексная визуализация опухолевых тканей с субклеточным разрешением методом массовой цитометрии. Nat. Методы 11 , 417–422 (2014).

CAS PubMed Google ученый

Джексон, H. W. et al. Пейзаж одноклеточной патологии рака груди. Природа 578 , 615–620 (2020).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Schulz, D. et al. Одновременная мультиплексная визуализация мРНК и белков с субклеточным разрешением в образцах ткани рака молочной железы методом массовой цитометрии. Cell Syst. 6 , 25–36.e5 (2018).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Saez-Ayala, M. et al. Направленное переключение фенотипа как эффективная стратегия борьбы с меланомой. Cancer Cell 24 , 105–119 (2013).

CAS PubMed Google ученый

Das Thakur, M. et al. Моделирование устойчивости к вемурафенибу при меланоме раскрывает стратегию предотвращения лекарственной устойчивости. Природа 494 , 251–255 (2013).

PubMed PubMed Central Google ученый

Venkatesh, V. et al. Нацеленность на сигнальный путь Notch раковых стволовых клеток. Исследование стволовых клеток. 5 , 5 (2018).

PubMed PubMed Central Google ученый

Amakye, D., Jagani, Z. & Dorsch, M. Раскрытие терапевтического потенциала пути Hedgehog при раке. Nat. Med. 19 , 1410–1422 (2013).

CAS PubMed Google ученый

Nusse, R. & Clevers, H. Передача сигналов Wnt / бета-катенина, болезнь и новые терапевтические методы. Cell 169 , 985–999 (2017).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

MacPherson, L. et al. HBO1 необходим для поддержания стволовых клеток лейкемии. Природа 577 , 266–270 (2020).

CAS PubMed Google ученый

Uckelmann, H. J. et al. Терапевтическое нацеливание на клетки прелейкемии на мышиной модели острого миелоидного лейкоза с мутантом NPM1. Наука 367 , 586–590 (2020).

CAS PubMed Google ученый

Кодд, А. С., Канасеки, Т., Ториго, Т. и Таби, З. Раковые стволовые клетки как мишени для иммунотерапии. Иммунология 153 , 304–314 (2018).

CAS PubMed Google ученый

Ши, Ю., Ду, Л., Лин, Л. и Ван, Ю. Мезенхимальные стволовые / стромальные клетки, ассоциированные с опухолью: новые терапевтические цели. Nat. Rev. Drug Discov. 16 , 35–52 (2017).

CAS PubMed Google ученый

Фридманн Анджели, Дж. П., Крыско, Д. В. и Конрад, М. Ферроптоз на перекрестке лекарственной устойчивости, вызванной раком, и уклонения от иммунитета. Nat. Rev. Cancer 19 , 405–414 (2019).

CAS PubMed Google ученый

Viswanathan, V. S. et al. Зависимость резистентного к терапии состояния раковых клеток от липидпероксидазного пути. Природа 547 , 453–457 (2017).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Hangauer, M. J. et al. Устойчивые к лекарствам персистирующие раковые клетки уязвимы к ингибированию GPX4. Природа 551 , 247–250 (2017).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Kinsey, C.G. et al. Защитная аутофагия, вызываемая ингибированием RAF–> MEK–> ERK, предлагает стратегию лечения рака, вызванного RAS. Nat. Med. 25 , 620–627 (2019).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Roesch, A. et al. Преодоление внутренней множественной лекарственной устойчивости при меланоме путем блокирования митохондриальной дыхательной цепи клеток JARID1B (high) с медленным циклом. Cancer Cell 23 , 811–825 (2013).

CAS PubMed Google ученый

МакКонки, Д. Дж. Комплексная реакция на стресс и протеотоксичность в терапии рака. Biochem. Биофиз. Res. Commun. 482 , 450–453 (2017).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Rzymski, T., Milani, M., Singleton, D. C. & Harris, A. L. Роль ATF4 в регуляции аутофагии и устойчивости к лекарствам и гипоксии. Cell Cycle 8 , 3838–3847 (2009).

CAS PubMed Google ученый

Falletta, P. et al. Перепрограммирование трансляции является эволюционно законсервированным фактором фенотипической пластичности и терапевтической резистентности при меланоме. Гены. Dev. 31 , 18–33 (2017).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Шлюева Д., Стампфель Г. и Старк А. Усилители транскрипции: от свойств к предсказаниям на уровне всего генома. Nat. Преподобный Жене. 15 , 272–286 (2014).

CAS PubMed Google ученый

Корсес, м.R. et al. Пейзаж доступности хроматина при первичном раке человека. Наука 362 , eaav1898 (2018).

PubMed PubMed Central Google ученый

Салями, Дж. И Крюс, К. М. Удаление отходов — привлекательная стратегия для лечения рака. Наука 355 , 1163–1167 (2017).

CAS PubMed Google ученый

Михалак, Э. М., Берр, М. Л., Баннистер, А. Дж. И Доусон, М. А. Роль метилирования ДНК, РНК и гистонов в старении и раке. Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 20 , 573–589 (2019).

CAS PubMed Google ученый

Tyler, D. S. et al. Click Chemistry позволяет проводить доклиническую оценку целевых эпигенетических методов лечения. Наука 356 , 1397–1401 (2017).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Доусон, М. А. Эпигеном рака: концепции, проблемы и терапевтические возможности. Наука 355 , 1147–1152 (2017).

CAS PubMed Google ученый

Sharma, A. et al. Продольное секвенирование одноклеточной РНК первичных клеток, полученных от пациента, выявляет вызванную лекарствами неверность в иерархии стволовых клеток. Nat. Commun. 9 , 4931 (2018).

PubMed PubMed Central Google ученый

Knoechel, B. et al. Эпигенетический механизм устойчивости к таргетной терапии при остром лимфобластном лейкозе Т-лимфоцитов. Nat. Genet. 46 , 364–370 (2014).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Wei, A.H. et al. Поддерживающее испытание QUAZAR AML-001: результаты международного рандомизированного двойного слепого плацебо-контролируемого исследования фазы III CC-486 (пероральная форма азацитидина) у пациентов с острым миелоидным лейкозом (ОМЛ) в первой ремиссии. Кровь 134 , LBA-3 (2019).

Google ученый

Nowell, P.C. Клональная эволюция популяций опухолевых клеток. Science 194 , 23–28 (1976).

CAS PubMed Google ученый

Gerlinger, M. et al. Геномная архитектура и эволюция светлоклеточных почечно-клеточных карцином, определенные с помощью мультирегионального секвенирования. Nat. Genet. 46 , 225–233 (2014).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Morrissy, A. S. et al. Пространственная неоднородность медуллобластомы. Nat. Genet. 49 , 780–788 (2017).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Jamal-Hanjani, M. et al. Отслеживание эволюции немелкоклеточного рака легкого. N. Engl. J. Med. 376 , 2109–2121 (2017).

CAS PubMed Google ученый

Hu, Z., Li, Z., Ma, Z. & Curtis, C. Анализ клональности и времени системного распространения в парных первичных опухолях и метастазах. Nat. Genet. 52 , 701–708 (2020).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Patch, A. M. et al. Полногеномная характеристика химиорезистентного рака яичников. Природа 521 , 489–494 (2015).

CAS PubMed Google ученый

Savas, P. et al. Субклональная архитектура метастатического рака молочной железы: результаты проспективной программы быстрой аутопсии на уровне сообщества «КАСКАД». PLoS Med. 13 , e1002204 (2016).

PubMed PubMed Central Google ученый

Chen, J. et al. Прогрессирование миелодиспластического синдрома в острый миелолейкоз на уровне стволовых клеток. Nat. Med. 25 , 103–110 (2019).

CAS PubMed Google ученый

Abbosh, C. et al. Филогенетический анализ цтДНК показывает эволюцию рака легких на ранней стадии. Природа 545 , 446–451 (2017).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый

Murtaza, M. et al. Неинвазивный анализ приобретенной устойчивости к терапии рака путем секвенирования ДНК плазмы. Природа 497 , 108–112 (2013).

CAS PubMed Google ученый

Scherer, F. et al. Отличительные биологические подтипы и закономерности эволюции генома лимфомы, выявленные циркулирующей опухолевой ДНК. Sci. Transl Med. 8 , 364ра155 (2016).

PubMed PubMed Central Google ученый

Yeh, P. et al. Циркулирующая ДНК опухоли отражает ответ на лечение и клональную эволюцию при хроническом лимфолейкозе. Nat. Commun. 8 , 14756 (2017).

CAS PubMed PubMed Central Google ученый